Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VN1R3Q9BXE9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VN1R3Q9BXE9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms