Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PHF7Q9BWX1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHF7Q9BWX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms