Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCMBPQ9BTE3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MCMBPQ9BTE3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms