Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COPS4Q9BT78 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COPS4Q9BT78 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms