Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms