Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
MESP1Q9BRJ9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MESP1Q9BRJ9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms