Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RGPD5Q99666 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RGPD5Q99666 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms