Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF3CQ99613 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF3CQ99613 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms