Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERGIC2Q96RQ1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERGIC2Q96RQ1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERGIC2Q96RQ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms