Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ARXQ96QS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ARXQ96QS3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms