Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF3Q96PU9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ODF3Q96PU9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms