Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf49Q96NF6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms