Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM227BQ96M60 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM227BQ96M60 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms