Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRC1Q96M27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRC1Q96M27 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms