Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C9orf72Q96LT7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms