Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PRAC1Q96KF2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms