Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VPS50Q96JG6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS50Q96JG6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms