Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LOXL4Q96JB6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LOXL4Q96JB6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms