Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC34Q96HJ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC34Q96HJ3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC34Q96HJ3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms