Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZC2HC1AQ96GY0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZC2HC1AQ96GY0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms