Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RRP36Q96EU6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RRP36Q96EU6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RRP36Q96EU6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms