Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD3Q96ES6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD3Q96ES6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms