Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CMTM5Q96DZ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CMTM5Q96DZ9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms