Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC39Q96DD0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LRRC39Q96DD0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms