Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SYTL4Q96C24 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYTL4Q96C24 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms