Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX21Q969T3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNX21Q969T3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms