Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF31Q8WWY3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF31Q8WWY3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms