Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC12Q8WVT3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC12Q8WVT3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms