Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D1Q8WV19 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D1Q8WV19 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms