Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX29Q8TEQ0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX29Q8TEQ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms