Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX54Q8TDD1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX54Q8TDD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX54Q8TDD1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms