Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATL2Q8NHH9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATL2Q8NHH9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 275.4 ms