Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
DNERQ8NFT8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNERQ8NFT8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms