Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC44

RETREG2, Reticulophagy regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG2Q8NC44 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RETREG2Q8NC44 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETREG2Q8NC44 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms