Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM87AQ8NBN3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TMEM87AQ8NBN3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms