Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMEM229BQ8NBD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM229BQ8NBD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms