Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNLDC1Q8NA58 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNLDC1Q8NA58 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms