Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MFSD2AQ8NA29 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265 ms