Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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TMCO5AQ8N6Q1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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TMCO5AQ8N6Q1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMCO5AQ8N6Q1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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