Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC47Q8N1G4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC47Q8N1G4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms