Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDKL3Q8IVW4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL3Q8IVW4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms