Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
P3H3Q8IVL6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
P3H3Q8IVL6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
P3H3Q8IVL6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
P3H3Q8IVL6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
P3H3Q8IVL6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
P3H3Q8IVL6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
P3H3Q8IVL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
P3H3Q8IVL6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
P3H3Q8IVL6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms