Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC6Q7Z403 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMC6Q7Z403 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms