Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RGPD4Q7Z3J3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RGPD4Q7Z3J3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RGPD4Q7Z3J3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms