Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG9AQ7Z3C6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATG9AQ7Z3C6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms