Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Q71RC1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q71RC1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q71RC1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q71RC1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q71RC1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q71RC1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q71RC1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q71RC1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms