Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACAD11Q709F0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACAD11Q709F0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms