Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM47EQ6ZV65 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM47EQ6ZV65 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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