Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PPP1R3FQ6ZSY5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms