Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf47Q6ZRZ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf47Q6ZRZ4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms